Le CQI a commencé à travailler au Burundi en 2009, en collaborant avec le programme COMPETE (Compétitivité et expansion du commerce en Afrique de l'Est) de l'USAID pour développer le Q Coffee System, collaborer et soutenir l'African Fine Coffees Association (AFCA) et élaborer des stratégies concurrentielles pour le café Robusta fin. L'objectif commun de ces organisations est de donner à tous les pays producteurs de café d'Afrique de l'Est la possibilité de maximiser leur efficacité sur le marché et d'accorder des primes à l'ensemble de la chaîne de valeur du café.
De 2008 à 2012, dans le cadre de ce programme, CQI a fourni des formations et une assistance technique au Burundi, en Éthiopie, au Kenya, au Malawi, en Tanzanie et en Ouganda. Un accent régional a réuni 13 personnes hautement qualifiées du Kenya, de l'Ouganda, de la Tanzanie et du Rwanda pour le premier cours de formation des formateurs Q Grader d'Afrique de l'Est. Tous les étudiants ont terminé le cours avec succès et sont maintenant des instructeurs Q assistants. Ted Lingle, ancien directeur exécutif du CQI et instructeur Q, a déclaré : "Ces personnes sont la "crème de la crème" des cuppers, et possèdent à la fois les compétences en matière de cupping et d'enseignement pour devenir d'excellents instructeurs de cupping."
En 2016, on estimait que sur les quelque 35 000 MT de café, les spécialités représentaient 2 %, mais ce chiffre pourrait atteindre 50 % à terme si ces programmes continuent d'être mis en œuvre. En fait, le Burundi en bénéficiera rapidement en raison de l'infrastructure actuelle des stations de lavage et de l'environnement de production de qualité. L'expédition et le transport sont des problèmes majeurs dans un pays enclavé comme le Burundi. Des formations pour les exportateurs sur la gestion du transport et la logistique, y compris la fixation de délais de livraison réalistes, sont nécessaires pour gérer les attentes et les contraintes.
S'appuyant sur le travail avec COMPETE, CQI a travaillé avec l'INTERCAFE (l'association locale de l'industrie du café) et l'ARFIC (l'agence gouvernementale locale de réglementation du café). Cette dernière a été soutenue dans le cadre d'un projet financé par l'ONUDI (Organisation des Nations unies pour le développement industriel), pour lequel le CQI a réalisé une évaluation en laboratoire et un séminaire sur le café de qualité pour les parties prenantes en 2016.
L'Institut de la qualité du café, en partenariat avec l'Organisation des Nations unies pour le développement industriel (ONUDI), s'est associé au Programme de renforcement des capacités commerciales au Burundi en 2018 pour proposer une formation de cupeur de café à un groupe restreint de professionnels de l'assurance qualité. Ce programme, financé par la Banque mondiale, visait à améliorer les performances du Burundi en matière d'exportation, à faciliter l'accès des produits aux marchés internationaux et régionaux, et à assurer le respect des réglementations sanitaires et phytosanitaires.